Homo sapiens Protein: SPTBN1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-51919.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SPTBN1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | spectrin, beta, non-erythrocytic 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | betaSpII; ELF; HEL102; SPTB2; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000334156 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-51911 (SPTBN1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Fodrin, which seems to be involved in secretion, interacts with calmodulin in a calcium-dependent manner and is thus candidate for the calcium-dependent movement of the cytoskeleton at the membrane. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Cytoplasm, myofibril, sarcomere, M line {ECO:0000250}. Note=Colocalizes with ANK2 in a distinct intracellular compartment of neonatal cardiomyocytes. {ECO:0000250}.Isoform 2: Cell membrane {ECO:0000250}; Peripheral membrane protein {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 2 is present in brain, lung and kidney (at protein level). {ECO:0000269PubMed:11665863}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 100 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001715
Calponin homology domain IPR002017 Spectrin repeat IPR016343 Spectrin, beta subunit IPR018159 Spectrin/alpha-actinin IPR022613 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein, CH domain |
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PFAM |
PF00307
PF00435 PF11971 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF002297
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SMART |
SM00033
SM00150 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q01082 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q01082 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8WYB3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6711 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.625136 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_842565 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11275 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 182790 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33199 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01683 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209748 AC092839 AC093110 AF218848 AF327441 AJ005694 AJ238723 BC137282 BC137283 CH471053 M96803 S65762 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA60580 AAB28324 AAI37283 AAI37284 AAL56651 AAO15362 AAY24229 BAD92985 CAA06678 CAB91088 EAX00147 | ||||||||||||||||||||||