Mus musculus Protein: Smchd1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-532421.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smchd1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | SMC hinge domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4931400A14Rik; AW554188; mKIAA0650; MommeD1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000121835 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-196873 (Smchd1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Required for maintenance of X inactivation in females and hypermethylation of CpG islands associated with inactive X. Involved in a pathway that mediates the methylation of a subset of CpG islands slowly and requires the de novo methyltransferase DNMT3B. May be required for DUX4 silencing in somatic cells. {ECO:0000269PubMed:18425126, ECO:0000269PubMed:22841499}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Chromosome {ECO:0000269PubMed:18425126}. Note=Localizes to Barr body. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1921605 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003594
Histidine kinase-like ATPase, ATP-binding domain IPR010935 SMCs flexible hinge |
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PFAM |
PF02518
PF13581 PF06470 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00387
SM00968 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6P5D8 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6P5D8 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 74355 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.413403 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_083163 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Smchd1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28958 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC107664 AC126942 AK016419 AK078494 AK129181 BC044905 BC058205 BC058618 BC062946 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH44905 AAH58205 AAH58618 AAH62946 BAB30222 BAC37307 BAC97991 | ||||||||||||||||||||||