Homo sapiens Protein: HDAC5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-53297.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HDAC5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | histone deacetylase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HD5; NY-CO-9; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000225983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-53295 (HDAC5) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Responsible for the deacetylation of lysine residues on the N-terminal part of the core histones (H2A, H2B, H3 and H4). Histone deacetylation gives a tag for epigenetic repression and plays an important role in transcriptional regulation, cell cycle progression and developmental events. Histone deacetylases act via the formation of large multiprotein complexes. Involved in muscle maturation by repressing transcription of myocyte enhancer MEF2C. During muscle differentiation, it shuttles into the cytoplasm, allowing the expression of myocyte enhancer factors. Involved in the MTA1-mediated epigenetic regulation of ESR1 expression in breast cancer. {ECO:0000269PubMed:24413532}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Note=Shuttles between the nucleus and the cytoplasm. In muscle cells, it shuttles into the cytoplasm during myocyte differentiation. The export to cytoplasm depends on the interaction with a 14-3-3 chaperone protein and is due to its phosphorylation at Ser-259 and Ser-498 by AMPK, CaMK1 and SIK1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 368 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000286
Histone deacetylase superfamily IPR017320 Histone deacetylase class II, eukaryotic IPR023801 Histone deacetylase domain IPR024643 Histone deacetylase, glutamine rich N-terminal domain |
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PFAM |
PF00850
PF12203 |
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PRINTS |
PR01270
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PIRSF |
PIRSF037911
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SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UQL6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UQL6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7EJZ7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.602536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001015053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB011172 AC023855 AF039691 AF132608 BC013140 BC051824 BK000028 BX458255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC18040 AAD29047 AAH13140 AAH51824 BAA25526 DAA00017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||