Mus musculus Protein: Irf8 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-533566.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Irf8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | interferon regulatory factor 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI893568; ICSBP; Icsbp1; IRF-8; Myls; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000125029 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-196509 (Irf8) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Specifically binds to the upstream regulatory region of type I IFN and IFN-inducible MHC class I genes (the interferon consensus sequence (ICS)). Plays a regulatory role in cells of the immune system. Involved in CD8(+) dendritic cell differentiation by forming a complex with the BATF-JUNB heterodimer in immune cells, leading to recognition of AICE sequence (5'-TGAnTCA/GAAA- 3'), an immune-specific regulatory element, followed by cooperative binding of BATF and IRF8 and activation of genes. {ECO:0000269PubMed:22992524}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:17579016}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Predominantly in lymphoid tissues. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 337 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 70 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:96395 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001346
Interferon regulatory factor DNA-binding domain IPR008984 SMAD/FHA domain IPR019471 Interferon regulatory factor-3 |
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PFAM |
PF00605
PF10401 |
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PRINTS |
PR00267
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00348
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P23611 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P23611 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q544J7 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15900 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.334861 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Irf8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22721 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK018533 AK036488 AK137450 AK146004 AK150320 AK151324 AK152906 AK153068 AK153395 AK154662 AK157249 AK157700 AK159835 BC005450 CH466525 CT010225 M32489 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA37878 AAH05450 BAB31258 BAC29448 BAE23355 BAE26825 BAE29465 BAE30305 BAE31586 BAE31694 BAE31957 BAE32750 BAE34013 BAE34155 BAE35413 CAJ18433 EDL11644 | ||||||||||||||||||||||||||||||