Mus musculus Protein: Syvn1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-534479.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Syvn1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | synovial apoptosis inhibitor 1, synoviolin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1200010C09Rik; AW211966; C85322; D530017H19Rik; Hrd1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000114960 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-134090 (Syvn1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Acts as an E3 ubiquitin-protein ligase which accepts ubiquitin specifically from endoplasmic reticulum-associated UBC7 E2 ligase and transfers it to substrates, promoting their degradation. Component of the endoplasmic reticulum quality control (ERQC) system also called ER-associated degradation (ERAD) involved in ubiquitin-dependent degradation of misfolded endoplasmic reticulum proteins. Also promotes the degradation of normal but naturally short-lived proteins such as SGK. Protects cells from ER stress-induced apoptosis. Sequesters p53/TP53 in the cytoplasm and promotes its degradation, thereby negatively regulating its biological function in transcription, cell cycle regulation and apoptosis. Required for embryogenesis. {ECO:0000269PubMed:12975321, ECO:0000269PubMed:15611074, ECO:0000269PubMed:17170702}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endoplasmic reticulum membrane {ECO:0000269PubMed:17059562}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000269PubMed:17059562}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed, with highest levels in bone, spleen, lung and testis. In the brain, present in neurons but not in glial cells. Up-regulated in synovial tissues from mice with collagen-induced arthritis (at protein level). {ECO:0000269PubMed:12975321, ECO:0000269PubMed:17059562}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 46 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1921376 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001841
Zinc finger, RING-type IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF00097 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00184
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9DBY1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9DBY1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YZH4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 74126 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001158181 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Syvn1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29487 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC131692 AK004688 AK122558 BC042199 BC046829 BC057917 BC080722 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH42199 AAH46829 AAH57917 AAH80722 BAB23474 BAC65840 | ||||||||||||||||||||||