Version 5.4
| Mus musculus Protein: Pou2f1 | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-535816.3 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Pou2f1 | ||||||||||||||||||||||
| Protein Name | POU domain, class 2, transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000125371 | ||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-202815 (Pou2f1) | ||||||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
| Function | Transcription factor that binds to the octamer motif (5'-ATTTGCAT-3') and activates the promoters of the genes for some small nuclear RNAs (snRNA) and of genes such as those for histone H2B and immunoglobulins. Modulates transcription transactivation by NR3C1, AR and PGR (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Ubiquitously expressed. However, isoforms 4 and 5 are only expressed in lymphocytes. {ECO:0000269PubMed:10023087, ECO:0000269PubMed:11683265, ECO:0000269PubMed:14729276, ECO:0000269PubMed:7711063}. | ||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 52 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:101898 | ||||||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR000327
POU-specific IPR000972 Octamer-binding transcription factor IPR001356 Homeobox domain IPR009057 Homeodomain-like IPR010982 Lambda repressor-like, DNA-binding domain IPR013847 POU domain |
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| PFAM |
PF00157
PF00046 PF13413 |
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| PRINTS |
PR00029
PR00028 |
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| PIRSF | |||||||||||||||||||||||
| SMART |
SM00352
SM00389 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-P25425 | ||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 18986 | ||||||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.448785 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | |||||||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Pou2f1 | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | |||||||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||||||