Mus musculus Protein: Prpf40b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-537311.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf40b | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610317D23Rik; Hypc; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000115869 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-182570 (Prpf40b) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May be involved in pre-mRNA splicing. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1925583 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001202
WW domain IPR002713 FF domain |
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PFAM |
PF00397
PF01846 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00456
SM00441 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80W14 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q80W14 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z1Y9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54614 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.407176 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_061256 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf40b | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27818 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC161198 AF135440 AK019183 AK140075 BC051961 BC082994 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD39464 AAH51961 AAH82994 BAB31591 BAE24230 | ||||||||||||||||||||||