Mus musculus Gene: Prpf40b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-182570.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf40b | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610317D23Rik; Hypc | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000023007 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000110844:
This gene encodes a WW-domain containing protein similar to yeast splicing factor PRP40. This protein has been shown to interact with Huntingtin and MeCP2. Alternative splicing results in different transcriptional variants. [provided by RefSeq, Jun 2012] This gene encodes a WW-domain containing protein similar to yeast splicing factor PRP40. This protein has been shown to interact with Huntingtin and methyl CpG binding protein 2 (MeCP2). Alternative splicing results in different transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:99295087-99317018 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z1Y9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54614 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.358668 Mm.407176 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_018786 XM_006521177 XM_006521178 XM_006521179 XM_006521180 XM_006521181 XM_006521182 XM_006521183 XM_006521184 XM_006521186 XM_006521187 XM_006521188 XM_006521189 XM_006521190 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27818 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1925583 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf40b | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC161198 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 54614 | ||||||||||||||||||||||