Homo sapiens Protein: SF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-54903.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | splicing factor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BBP; D11S636; MBBP; ZCCHC25; ZFM1; ZNF162; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000334414 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54901 (SF1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Necessary for the ATP-dependent first step of spliceosome assembly. Binds to the intron branch point sequence (BPS) 5'-UACUAAC-3' of the pre-mRNA. May act as transcription repressor. {ECO:0000269PubMed:10449420, ECO:0000269PubMed:8752089, ECO:0000269PubMed:9660765}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in lung, ovary, adrenal gland, colon, kidney, muscle, pancreas, thyroid, placenta, brain, liver and heart. {ECO:0000269PubMed:7912130}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 121 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001878
Zinc finger, CCHC-type IPR004087 K Homology domain IPR004088 K Homology domain, type 1 |
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PFAM |
PF00098
PF00013 PF13014 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00343
SM00322 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q15637 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-AAB03514 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q14821 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7536 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.613898 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_973724 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12950 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601516 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8080 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03306 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ000051 AJ000052 AK293753 AP001462 BC000773 BC008080 BC008724 BC011657 BC020217 BC038446 CH471076 D26120 D26122 L49345 L49380 Y08765 Y08766 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB03514 AAB04033 AAH00773 AAH08080 AAH08724 AAH20217 AAH38446 BAA05116 BAA05117 BAA05119 BAH11587 CAA03883 CAA70018 CAA70019 EAW74288 EAW74294 | ||||||||||||||||||||||