Homo sapiens Gene: SF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54901.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | splicing factor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BBP; D11S636; MBBP; ZCCHC25; ZFM1; ZNF162 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168066 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
splicing factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear pre-mRNA splicing factor. The encoded protein specifically recognizes the intron branch point sequence and is required for the early stages of spliceosome assembly. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:64764606-64778786 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 121 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.502829 Hs.613898 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001178030 NM_001178031 NM_004630 NM_201995 NM_201997 NM_201998 XM_006718681 XM_006718682 XM_006718683 XM_006718684 XM_006718685 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31599 CCDS44642 CCDS53660 CCDS53661 CCDS8080 CCDS8081 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03306 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||