Version 5.4
| Homo sapiens Protein: CNTN5 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-585798.3 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | CNTN5 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | contactin 5 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000436185 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-68747 (CNTN5) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Contactins mediate cell surface interactions during nervous system development. Has some neurite outgrowth-promoting activity in the cerebral cortical neurons but not in hippocampal neurons. Probably involved in neuronal activity in the auditory system (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000250}; Lipid-anchor, GPI-anchor {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Expressed in brain and kidney and at very low level in placenta. Not expressed in other tissues. In brain, it is highly expressed in the occipital lobe, amygdala, cerebral cortex, frontal lobe, thalamus and temporal lobe. Expressed at moderate level in the cerebellum, substantia nigra, putamen, medulla and hippocampus. Weakly expressed in the spinal cord and caudate nucleus. Weakly or not expressed in the corpus callosum. {ECO:0000269PubMed:11013081}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003598
Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR003961 Fibronectin, type III IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin |
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| PFAM |
PF00041
PF01108 PF07679 PF07686 PF00047 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00408
SM00409 SM00060 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | O94779 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-O94779 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | B4DGP0 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 53942 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.742241 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001230199 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:2175 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 607219 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS53696 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 06241 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB013802 AB013803 AK294692 AP000760 AP000798 AP000923 AP001892 AP001988 AP002378 AP002428 AP002987 AP003126 AP003441 AP003558 AP004249 BC039255 BC130619 BC144185 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH39255 AAI30620 AAI44186 BAA36579 BAA36580 BAG57851 | ||||||||||||||||||