Homo sapiens Protein: SETD1B | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-586552.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SETD1B | ||||||||||||||||||
Protein Name | SET domain containing 1B | ||||||||||||||||||
Synonyms | KMT2G; Set1B; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000442924 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-62002 (SETD1B) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Histone methyltransferase that specifically methylates 'Lys-4' of histone H3, when part of the SET1 histone methyltransferase (HMT) complex, but not if the neighboring 'Lys- 9' residue is already methylated. H3 'Lys-4' methylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional activation. The non-overalpping localization with SETD1A suggests that SETD1A and SETD1B make non-redundant contributions to the epigenetic control of chromatin structure and gene expression. Specifically tri-methylates 'Lys-4' of histone H3 in vitro. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000269PubMed:17355966}. Chromosome {ECO:0000269PubMed:17355966}. Note=Localizes to a largely non- overlapping set of euchromatic nuclear speckles with SETD1A, suggesting that SETD1A and SET1B each bind to a unique set of target genes. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR001214 SET domain IPR003616 Post-SET domain IPR024657 COMPASS complex Set1 subunit, N-SET domain |
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PFAM |
PF00076
PF00856 PF11764 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00317 SM00508 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UPS6 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UPS6 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23067 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.612133 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_055863 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:29187 | ||||||||||||||||||
OMIM | 611055 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53838 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB028999 AC079360 AC084018 JF813787 | ||||||||||||||||||
GenPept | AEG67286 BAA83028 | ||||||||||||||||||