Homo sapiens Protein: CHD4 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-586794.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | chromodomain helicase DNA binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000440392 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14532 (CHD4) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Component of the histone deacetylase NuRD complex which participates in the remodeling of chromatin by deacetylating histones. {ECO:0000269PubMed:17626165, ECO:0000269PubMed:9804427}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:17626165}. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome {ECO:0000269PubMed:17626165}. Note=Associates with centrosomes in interphase. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 115 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000330
SNF2-related IPR000953 Chromo domain/shadow IPR001650 Helicase, C-terminal IPR001965 Zinc finger, PHD-type IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR009057 Homeodomain-like IPR009071 High mobility group box domain IPR009462 Domain of unknown function DUF1086 IPR009463 Domain of unknown function DUF1087 IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR012957 CHD, C-terminal 2 IPR012958 CHD, N-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR016197 Chromo domain-like IPR019787 Zinc finger, PHD-finger IPR021006 Histone deacetylase complex, subunit 2/3 IPR023780 Chromo domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00176
PF00271 PF04851 PF00505 PF09011 PF06461 PF06465 PF08074 PF08073 PF00628 PF11496 PF00385 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00298
SM00490 SM00249 SM00398 SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1108 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.605320 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006719021 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1919 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603277 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04472 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC006064 BC038596 X86691 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH38596 CAA60384 | ||||||||||||||||||||||||||