Homo sapiens Protein: RBM10 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-59678.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBM10 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA binding motif protein 10 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | DXS8237E; GPATC9; GPATCH9; S1-1; TARPS; ZRANB5; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000328848 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-59674 (RBM10) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May be involved in post-transcriptional processing, most probably in mRNA splicing. Binds to RNA homopolymers, with a preference for poly(G) and poly(U) and little for poly(A) (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:18315527}. Note=In the extranucleolar nucleoplasm constitutes hundreds of nuclear domains, which dynamically change their structures in a reversible manner. Upon globally reducing RNA polymerase II transcription, the nuclear bodies enlarge and decrease in number. They occur closely adjacent to nuclear speckles or IGCs (interchromatin granule clusters) but coincide with TIDRs (transcription-inactivation-dependent RNA domains). | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | TARP syndrome (TARPS) [MIM:311900]: A disorder characterized by the Robin sequence (micrognathia, glossoptosis and cleft palate), talipes equinovarus and cardiac defects. {ECO:0000269PubMed:20451169}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 80 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000467
G-patch domain IPR000504 RNA recognition motif domain IPR001876 Zinc finger, RanBP2-type IPR007087 Zinc finger, C2H2 |
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PFAM |
PF01585
PF00076 PF00641 PF00096 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00443
SM00360 SM00547 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P98175 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P98175 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8241 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.675736 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001191397 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9896 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 300080 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS75969 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02095 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK292758 AL137421 AL513366 BC003089 BC004181 BC008733 BC024153 CH471164 D50912 U35373 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB33572 AAH03089 AAH04181 AAH08733 AAH24153 BAA09471 BAF85447 CAB70731 CAI41700 EAW59283 EAW59284 EAW59285 EAW59287 | ||||||||||||||||||||||