Homo sapiens Protein: LIG1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-60040.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LIG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | ligase I, DNA, ATP-dependent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000263274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-60038 (LIG1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000977
DNA ligase, ATP-dependent IPR012308 DNA ligase, ATP-dependent, N-terminal IPR012309 DNA ligase, ATP-dependent, C-terminal IPR012310 DNA ligase, ATP-dependent, central IPR012340 Nucleic acid-binding, OB-fold |
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PFAM |
PF04675
PF04679 PF01068 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P18858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P18858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q76GR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.738849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6598 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 126391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00534 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB103328 AC011466 AF527418 AK314210 BC108318 CH471177 M36067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA59518 AAI08319 AAM77697 BAC81763 BAG36885 EAW52316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||