Homo sapiens Protein: IGHMBP2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-61680.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IGHMBP2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | immunoglobulin mu binding protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CATF1; HCSA; HMN6; SMARD1; SMUBP2; ZFAND7; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000255078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-61678 (IGHMBP2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | 5' to 3' helicase that unwinds RNA and DNA duplices in an ATP-dependent reaction. Acts as a transcription regulator. Required for the transcriptional activation of the flounder liver- type antifreeze protein gene. Exhibits strong binding specificity to the enhancer element B of the flounder antifreeze protein gene intron. Binds to the insulin II gene RIPE3B enhancer region. May be involved in translation (By similarity). DNA-binding protein specific to 5'-phosphorylated single-stranded guanine-rich sequence related to the immunoglobulin mu chain switch region. Preferentially binds to the 5'-GGGCT-3' motif. Interacts with tRNA-Tyr. Stimulates the transcription of the human neurotropic virus JCV. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:19158098, ECO:0000269PubMed:19299493}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:19299493}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:19299493}. Cell projection, axon {ECO:0000250}. Note=Colocalizes with the translation initiation factor EIF4G2. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Neuronopathy, distal hereditary motor, 6 (HMN6) [MIM:604320]: A neuromuscular disorder. Distal hereditary motor neuronopathies constitute a heterogeneous group of neuromuscular disorders caused by selective degeneration of motor neurons in the anterior horn of the spinal cord, without sensory deficit in the posterior horn. The overall clinical picture consists of a classical distal muscular atrophy syndrome in the legs without clinical sensory loss. The disease starts with weakness and wasting of distal muscles of the anterior tibial and peroneal compartments of the legs. Later on, weakness and atrophy may expand to the proximal muscles of the lower limbs and/or to the distal upper limbs. {ECO:0000269PubMed:11528396, ECO:0000269PubMed:14681881, ECO:0000269PubMed:15108294, ECO:0000269PubMed:15797190, ECO:0000269PubMed:17431882, ECO:0000269PubMed:18802676}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in all tissues examined. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000058
Zinc finger, AN1-type IPR001374 Single-stranded nucleic acid binding R3H IPR003593 AAA+ ATPase domain IPR004483 Helicase SMUBP-2/Hcs1-like IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF01428
PF01424 PF04851 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00154
SM00393 SM00382 SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P38935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P38935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H5K3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.604969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AP000808 BC025299 L14754 L24544 M64979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA53082 AAA58611 AAA70430 AAH25299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||