Mus musculus Protein: Sox6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-620256.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sox6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | SRY-box containing gene 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI987981; SOX-LZ; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000129027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-207342 (Sox6) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcriptional activator. Binds specifically to the DNA sequence 5'-AACAAT-3'. Plays a key role in several developmental processes, including neurogenesis and skeleton formation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00267}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in testis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:98368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR009071
High mobility group box domain |
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PFAM |
PF00505
PF09011 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00398
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P40645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P40645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3V1J7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.471373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006507571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Sox6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ010605 AK132409 CH466531 D61689 U32614 X65659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC52263 BAA09618 BAE21153 CAA09270 CAA46610 EDL17084 EDL17085 EDL17086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||