Mus musculus Protein: Dnmt3a | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-622427.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dnmt3a | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | DNA methyltransferase 3A | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MmuIIIA; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000134009 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-127800 (Dnmt3a) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Required for genome-wide de novo methylation and is essential for the establishment of DNA methylation patterns during development. DNA methylation is coordinated with methylation of histones. It modifies DNA in a non-processive manner and also methylates non-CpG sites. May preferentially methylate DNA linker between 2 nucleosomal cores and is inhibited by histone H1. Plays a role in paternal and maternal imprinting. Required for methylation of most imprinted loci in germ cells. Acts as a transcriptional corepressor for ZBTB18. Recruited to trimethylated 'Lys-36' of histone H3 (H3K36me3) sites. Can actively repress transcription through the recruitment of HDAC activity. {ECO:0000269PubMed:10555141, ECO:0000269PubMed:11350943, ECO:0000269PubMed:11399089, ECO:0000269PubMed:11919202, ECO:0000269PubMed:15215868, ECO:0000269PubMed:16567415, ECO:0000269PubMed:17713477, ECO:0000269PubMed:18823905}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:12138111, ECO:0000269PubMed:15456878, ECO:0000269PubMed:20547484}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Note=Accumulates in the major satellite repeats at pericentric heterochromatin. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 1 is expressed ubiquitously at low levels. Expression of isoform 2 is restricted to tissues containing cells which are undergoing active de novo methylation, including spleen, testis and thymus. {ECO:0000269PubMed:12138111}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 28 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 39 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1261827 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000313
PWWP domain IPR001525 C-5 cytosine methyltransferase IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR029063 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase-like |
||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00855
PF00145 |
||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00105
|
||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00293
|
||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O88508 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O88508 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3UWR0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13435 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.5001 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3SWC | ||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Dnmt3a | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36397 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC159324 AF068625 AF480164 AK013096 AK090132 AK136170 AK147263 AK147627 AK147642 AK147676 AK157792 BC007466 CR974568 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC40177 AAH07466 AAN40038 BAB28644 BAC41110 BAE22854 BAE27806 BAE28033 BAE28043 BAE28067 BAE34200 | ||||||||||||||||||||||||||||||