Homo sapiens Protein: CLIP1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-62404.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLIP1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | CAP-GLY domain containing linker protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CLIP; CLIP-170; CLIP170; CYLN1; RSN; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000303585 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-62398 (CLIP1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Binds to the plus end of microtubules and regulates the dynamics of the microtubule cytoskeleton. Promotes microtubule growth and microtubule bundling. Links cytoplasmic vesicles to microtubules and thereby plays an important role in intracellular vesicle trafficking. Plays a role macropinocytosis and endosome trafficking. {ECO:0000269PubMed:12433698, ECO:0000269PubMed:17563362, ECO:0000269PubMed:17889670}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Cytoplasm, cytoskeleton. Cytoplasmic vesicle membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cell projection, ruffle. Note=Associated with the cytoskeleton. Detected at the plus ends of microtubules in the cytosol, and close to plasma membrane ruffles. Associates with the membranes of intermediate macropinocytic vesicles. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in dendritic cells (at protein level). Highly expressed in the Reed-Sternberg cells of Hodgkin disease. {ECO:0000269PubMed:12433698, ECO:0000269PubMed:1600942}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 32 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000938
CAP Gly-rich domain IPR001878 Zinc finger, CCHC-type IPR009053 Prefoldin |
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PFAM |
PF01302
PF00098 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM01052
SM00343 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P30622 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P30622 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H367 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6249 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.682942 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10461 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 179838 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9232 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01568 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC048338 AC079406 AC093016 AC127002 BC114213 BC117209 BC126305 CH471054 M97501 X64838 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35693 AAI14214 AAI17210 AAI26306 CAA46050 EAW98321 EAW98322 | ||||||||||||||||||||||