Mus musculus Protein: Rab1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-627133.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rab1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | RAB1, member RAS oncogene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gtbp; mKIAA3012; Rab-1; Rab1A; Ypt1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000127330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-152605 (Rab1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | The small GTPases Rab are key regulators of intracellular membrane trafficking, from the formation of transport vesicles to their fusion with membranes. Rabs cycle between an inactive GDP-bound form and an active GTP-bound form that is able to recruit to membranes different sets of downstream effectors directly responsible for vesicle formation, movement, tethering and fusion. RAB1A regulates vesicular protein transport from the endoplasmic reticulum (ER) to the Golgi compartment and on to the cell surface, and plays a role in IL-8 and growth hormone secretion. Regulates the level of CASR present at the cell membrane. Plays a role in cell adhesion and cell migration, via its role in protein trafficking. Plays a role in autophagosome assembly and cellular defense reactions against pathogenic bacteria (By similarity). Plays a role in microtubule-dependent protein transport by early endosomes and in anterograde melanosome transport. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:20639577, ECO:0000269PubMed:22854043}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Golgi apparatus {ECO:0000250}. Endoplasmic reticulum {ECO:0000250}. Early endosome {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytosol {ECO:0000250}. Membrane {ECO:0000250}. Melanosome {ECO:0000269PubMed:22854043}. Note=Alternates between membrane- associated and cytosolic forms. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 40 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:97842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000795
Elongation factor, GTP-binding domain IPR001806 Small GTPase superfamily IPR002041 Ran GTPase IPR003578 Small GTPase superfamily, Rho type IPR003579 Small GTPase superfamily, Rab type IPR005225 Small GTP-binding protein domain IPR006689 Small GTPase superfamily, ARF/SAR type IPR006762 Gtr1/RagA G protein IPR013684 Mitochondrial Rho-like IPR019009 Signal recognition particle receptor, beta subunit IPR020849 Small GTPase superfamily, Ras type IPR024156 Small GTPase superfamily, ARF type IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00009
PF00071 PF00025 PF04670 PF08477 PF09439 |
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PRINTS |
PR00315
PR00449 PR00627 PR00328 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00176
SM00174 SM00175 SM00173 SM00177 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P62821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P62821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5SW88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 19324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.491009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_033022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rab1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB232583 AF226873 AK034408 AK159425 AK166249 AK167150 AL606522 BC002077 CH466595 X15744 X15745 X15746 X15747 Y00094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF33844 AAH02077 BAC28697 BAE35072 BAE38660 BAE39292 BAF02845 CAA33760 CAA68284 EDL07829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||