Homo sapiens Protein: NR1H2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-64320.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NR1H2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | nuclear receptor subfamily 1, group H, member 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LXR-b; LXRB; NER; NER-I; RIP15; UNR; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000253727 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-64316 (NR1H2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Nuclear receptor. Binds preferentially to double- stranded oligonucleotide direct repeats having the consensus half- site sequence 5'-AGGTCA-3' and 4-nt spacing (DR-4). Regulates cholesterol uptake through MYLIP-dependent ubiquitination of LDLR, VLDLR and LRP8; DLDLR and LRP8. Interplays functionally with RORA for the regulation of genes involved in liver metabolism (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00407}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 86 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000536
Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core IPR001628 Zinc finger, nuclear hormone receptor-type IPR001723 Steroid hormone receptor IPR001728 Thyroid hormone receptor IPR003069 Ecdysteroid receptor IPR008946 Nuclear hormone receptor, ligand-binding IPR023257 Liver X receptor |
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PFAM |
PF00104
PF00105 |
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PRINTS |
PR00047
PR00398 PR00546 PR01283 PR02034 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00430
SM00399 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P55055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P55055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | M0R3A7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.718380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_009052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS42593 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02660 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC008655 AK290855 AK297978 BC007790 BC033500 BC047750 BC074500 CH471135 HQ692835 U07132 U14534 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA58594 AAA61783 AAH07790 AAH33500 AAH47750 AAH74500 ADZ17346 BAF83544 BAG60288 EAW71852 EAW71853 EAW71854 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||