Homo sapiens Protein: DDX5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-64776.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | G17P1; HLR1; HUMP68; p68; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000225792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-64774 (DDX5) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Involved in the alternative regulation of pre-mRNA splicing; its RNA helicase activity is necessary for increasing tau exon 10 inclusion and occurs in a RBM4-dependent manner. Binds to the tau pre-mRNA in the stem-loop region downstream of exon 10. The rate of ATP hydrolysis is highly stimulated by single-stranded RNA. Involved in transcriptional regulation; the function is independent of the RNA helicase activity. Transcriptional coactivator for estrogen receptor ESR1 and androgen receptor AR. Increases ESR1 AF-1 domain-mediated transactivation and ESR1 AF-1 and AF-2 domains transcriptional synergistic activity. Synergizes with DDX17 and SRA1 RNA to activate MYOD1 transcriptional activity and involved in skeletal muscle differentiation. Transcriptional coactivator for p53/TP53 and involved in p53/TP53 transcriptional response to DNA damage and p53/TP53-dependent apoptosis. Transcriptional coactivator for RUNX2 and involved in regulation of osteoblast differentiation. Acts as transcriptional repressor in a promoter-specicic manner; the function probbaly involves association with histone deacetylases, such as HDAC1. As component of a large PER complex is involved in the inhibition of 3' transcriptional termination of circadian target genes such as PER1 and NR1D1 and the control of the circadian rhythms. {ECO:0000269PubMed:10409727, ECO:0000269PubMed:11250900, ECO:0000269PubMed:12527917, ECO:0000269PubMed:15298701, ECO:0000269PubMed:15660129, ECO:0000269PubMed:17011493, ECO:0000269PubMed:17960593, ECO:0000269PubMed:18829551, ECO:0000269PubMed:19718048, ECO:0000269PubMed:21343338}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000269PubMed:10837141, ECO:0000269PubMed:1996094}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 230 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR012587 P68HR IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00270 PF08061 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P17844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P17844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | J3QS97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1655 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.733208 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2746 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 180630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB451257 AC009994 AF015812 AJ010931 BC016027 BT006943 CH471109 X15729 X52104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB84094 AAH16027 AAP35589 BAG70071 CAA09408 CAA33751 CAA36324 EAW94202 EAW94203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||