Homo sapiens Protein: MAP1LC3A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-68518.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MAP1LC3A | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000363970 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68516 (MAP1LC3A) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like modifier involved in formation of autophagosomal vacuoles (autophagosomes). Whereas LC3s are involved in elongation of the phagophore membrane, the GABARAP/GATE-16 subfamily is essential for a later stage in autophagosome maturation. {ECO:0000269PubMed:20713600}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton. Endomembrane system; Lipid-anchor. Cytoplasmic vesicle, autophagosome membrane; Lipid-anchor. Note=LC3-II binds to the autophagic membranes. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Most abundant in heart, brain, liver, skeletal muscle and testis but absent in thymus and peripheral blood leukocytes. {ECO:0000269PubMed:12740394}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 152 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004241
Autophagy protein Atg8 ubiquitin like IPR007242 Ubiquitin-like protein Atg12 IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF02991
PF04110 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9H492 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9H492 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 84557 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_852610 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6838 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601242 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13237 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03144 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF276658 AL118520 AL833855 BC015810 BT007452 CH471077 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH15810 AAK35151 AAP36120 CAC14078 CAD38714 CAI40290 EAW76263 EAW76264 EAW76265 EAW76266 | ||||||||||||||||||||||