Bos taurus Protein: GABARAP | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-686439.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GABARAP | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000019814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-634658 (GABARAP) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like modifier that play a role in intracellular transport of GABA(A) receptors and its interaction with the cytoskeleton. Involved in apoptosis. Involved in autophagy. Whereas LC3s are involved in elongation of the phagophore membrane, the GABARAP/GATE-16 subfamily is essential for a later stage in autophagosome maturation (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endomembrane system {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Golgi apparatus membrane {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle, autophagosome {ECO:0000250}. Note=Largely associated with intracellular membrane structures including the Golgi apparatus and postsynaptic cisternae. Colocalizes with microtubules (By similarity). Localizes also to discrete punctae along the ciliary axoneme (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 76 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004241
Autophagy protein Atg8 ubiquitin like IPR007242 Ubiquitin-like protein Atg12 IPR029071 Ubiquitin-related domain |
||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF02991
PF04110 |
||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9GJW7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 327715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.49217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001029220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ297742 BC103060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI03061 CAC12804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||