Homo sapiens Protein: ABCB9 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-717541.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | ABCB9 | ||||||||||||||||||
Protein Name | |||||||||||||||||||
Synonyms | EST122234; TAPL; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000456375 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-63048 (ABCB9) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | ATP-dependent low-affinity peptide transporter which translocates a broad spectrum of peptides from the cytosol to the lysosomal lumen. Displays a broad peptide length specificity from 6-mer up to at least 59-mer peptides with an optimum of 23-mers. Favors positively charged, aromatic or hydrophobic residues in the N- and C-terminal positions whereas negatively charged residues as well as asparagine and methionine are not favored. {ECO:0000269PubMed:15863492, ECO:0000269PubMed:17977821, ECO:0000269PubMed:18434309}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Lysosome membrane {ECO:0000269PubMed:10748049, ECO:0000269PubMed:15577206, ECO:0000269PubMed:17897319, ECO:0000269PubMed:17977821, ECO:0000269PubMed:18175933, ECO:0000269PubMed:18952056, ECO:0000269PubMed:20377823, ECO:0000269PubMed:21212514}; Multi- pass membrane protein {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00441, ECO:0000269PubMed:10748049, ECO:0000269PubMed:15577206, ECO:0000269PubMed:17897319, ECO:0000269PubMed:17977821, ECO:0000269PubMed:18175933, ECO:0000269PubMed:18952056, ECO:0000269PubMed:20377823, ECO:0000269PubMed:21212514}. Note=May be located in membrane rafts. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in testis, and at moderate levels in brain, spinal cord, and thyroid. Not expressed in monocytes but strongly expressed during differentiation of monocytes to dendritic cells and macrophages. {ECO:0000269PubMed:10748049, ECO:0000269PubMed:17977821}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001140
ABC transporter, transmembrane domain IPR003439 ABC transporter-like IPR003593 AAA+ ATPase domain IPR011527 ABC transporter type 1, transmembrane domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00664
PF13748 PF00005 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00382
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NP78 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NP78 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H5I5 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23457 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.511951 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_982269 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:50 | ||||||||||||||||||
OMIM | 605453 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS58288 | ||||||||||||||||||
HPRD | 09262 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB040953 AB045381 AB112582 AB112583 AB177852 AC026362 AC027290 AF216494 AK304295 BC017348 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAF89993 AAH17348 BAA96044 BAA97989 BAC98409 BAC98410 BAD66830 BAG65152 | ||||||||||||||||||