Homo sapiens Protein: RNF4 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-7541.5 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RNF4 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | ring finger protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SLX5; SNURF; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000315212 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-7539 (RNF4) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase which binds polysumoylated chains covalently attached to proteins and mediates 'Lys-6'-, 'Lys-11'-, 'Lys-48'- and 'Lys-63'-linked polyubiquitination of those substrates and their subsequent targeting to the proteasome for degradation. Regulates the degradation of several proteins including PML and the transcriptional activator PEA3. Involved in chromosome alignment and spindle assembly, it regulates the kinetochore CENPH-CENPI-CENPK complex by targeting polysumoylated CENPI to proteasomal degradation. Regulates the cellular responses to hypoxia and heat shock through degradation of respectively EPAS1 and PARP1. Alternatively, it may also bind DNA/nucleosomes and have a more direct role in the regulation of transcription for instance enhancing basal transcription and steroid receptor- mediated transcriptional activation. {ECO:0000269PubMed:12885770, ECO:0000269PubMed:18408734, ECO:0000269PubMed:19307308, ECO:0000269PubMed:20026589, ECO:0000269PubMed:20212317, ECO:0000269PubMed:20943951}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus. Nucleus, PML body. Nucleus, nucleoplasm. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed at low levels in many tissues; highly expressed in testis. {ECO:0000269PubMed:9479498}. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 65 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001841
Zinc finger, RING-type IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF00097 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00184
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P78317 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P78317 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RJF5 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6047 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.740360 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002929 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10067 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602850 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47001 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04167 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB000468 AK128038 AK309509 AK312534 AL110117 AL645924 BC031935 BX322586 CR450722 CR545473 U95140 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC52022 AAH31935 BAA19122 BAG35433 BAG54620 | ||||||||||||||||||||||||||