Homo sapiens Gene: RNF4 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-7539.5 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RNF4 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SLX5; SNURF | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000063978 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
ring finger protein 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene contains a RING finger motif and acts as a transcription regulator. This protein has been shown to interact with, and inhibit the activity of, TRPS1, a transcription suppressor of GATA-mediated transcription. Transcription repressor ZNF278/PATZ is found to interact with this protein, and thus reduce the enhancement of androgen receptor-dependent transcription mediated by this protein. Studies of the mouse and rat counterparts suggested a role of this protein in spermatogenesis. A pseudogene of this gene is found on chromosome 1.[provided by RefSeq, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:2462220-2625320 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | p16.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 65 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.740360 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001185009 NM_001185010 NM_002938 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47001 CCDS54713 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04167 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||