Homo sapiens Protein: SEMA4D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-75428.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEMA4D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C9orf164; CD100; coll-4; M-sema-G; SEMAJ; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000348822 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-75424 (SEMA4D) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Cell surface receptor for PLXN1B and PLXNB2 that plays an important role in cell-cell signaling. Promotes reorganization of the actin cytoskeleton and plays a role in axonal growth cone guidance in the developing central nervous system. Regulates dendrite and axon branching and morphogenesis. Promotes the migration of cerebellar granule cells and of endothelial cells. Plays a role in the immune system; induces B-cells to aggregate and improves their viability (in vitro). Promotes signaling via SRC and PTK2B/PYK2, which then mediates activation of phosphatidylinositol 3-kinase and of the AKT1 signaling cascade. Interaction with PLXNB1 mediates activation of RHOA. {ECO:0000269PubMed:16055703, ECO:0000269PubMed:19788569, ECO:0000269PubMed:20877282, ECO:0000269PubMed:8876214}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:20877282, ECO:0000269PubMed:8876214}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:20877282, ECO:0000269PubMed:8876214}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Strongly expressed in skeletal muscle, peripheral blood lymphocytes, spleen, and thymus and also expressed at lower levels in testes, brain, kidney, small intestine, prostate, heart, placenta, lung and pancreas, but not in colon and liver. {ECO:0000269PubMed:8876214}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001627
Sema domain IPR002165 Plexin IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013151 Immunoglobulin IPR016201 Plexin-like fold |
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PFAM |
PF01403
PF01437 PF00047 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00630
SM00408 SM00409 SM00423 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92854 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q92854 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.601897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK097056 AL590233 AL929575 BC054500 BC137515 BC137518 U60800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC50810 AAH54500 AAI37516 AAI37519 BAC04938 CAI17379 CAI43250 CAI95794 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||