Homo sapiens Protein: DDX21 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-76285.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX21 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 21 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | GUA; GURDB; RH-II/GU; RH-II/GuA; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000346120 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-76283 (DDX21) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Can unwind double-stranded RNA (helicase) and can fold or introduce a secondary structure to a single-stranded RNA (foldase). Functions as cofactor for JUN-activated transcription. Involved in rRNA processing. {ECO:0000269PubMed:11823437, ECO:0000269PubMed:14559904}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000269PubMed:8614622}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 118 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR012562 GUCT IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF04851 PF00270 PF08152 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NR30 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NR30 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8NI92 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9188 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.715912 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004719 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2744 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 606357 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31211 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05895 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB062394 AF261903 AF261904 AF261905 AF261906 AF261907 AF261908 AF261909 AF261910 AF261911 AF261912 AF261913 AF261914 AF261915 AF261916 AF261917 AK315585 AL359844 BC008071 CH471083 CR749598 U41387 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB02546 AAF78930 AAH08071 BAB93481 BAG37957 CAH18395 CAH72377 EAW54307 | ||||||||||||||||||||||