Homo sapiens Protein: POU5F1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-77212.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | POU5F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | POU class 5 homeobox 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Oct-3; Oct-4; OCT3; OCT4; OTF-3; OTF3; OTF4; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000259915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-77210 (POU5F1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcription factor that binds to the octamer motif (5'-ATTTGCAT-3'). Forms a trimeric complex with SOX2 on DNA and controls the expression of a number of genes involved in embryonic development such as YES1, FGF4, UTF1 and ZFP206. Critical for early embryogenesis and for embryonic stem cell pluripotency. {ECO:0000269PubMed:18035408}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus. Note=Expressed in a diffuse and slightly punctuate pattern. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in developing brain. Highest levels found in specific cell layers of the cortex, the olfactory bulb, the hippocampus and the cerebellum. Low levels of expression in adult tissues. {ECO:0000269PubMed:1408763, ECO:0000269PubMed:7908264}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 43 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 315 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000327
POU-specific IPR001356 Homeobox domain IPR009057 Homeodomain-like IPR010982 Lambda repressor-like, DNA-binding domain IPR013847 POU domain |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00157
PF00046 PF13413 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00028
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00352
SM00389 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q01860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q01860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | U3KQH6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.646545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 164177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01252 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB088113 AB103619 AB202105 AL662833 AL662844 AL773544 BA000025 BC117435 BC117437 BX088580 CH471081 CR388229 CR759815 CR847794 FM177951 FM177952 FM177953 FM177954 FM177955 FM177956 FM177957 FM177958 FM177960 FM177961 FM177962 FM177963 FM177964 FM177965 FM177966 FM177968 GQ472773 GU480808 GU480811 GU480812 GU480816 GU480818 GU480824 GU480828 GU480830 HQ122660 HQ122662 HQ122664 HQ122667 HQ122668 HQ122669 HQ122670 HQ122672 HQ122673 HQ122674 HQ122675 KC312698 S81255 Z11898 Z11899 Z21963 Z21964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB35990 AAI17436 AAI17438 ACZ95699 ACZ95700 ADE48539 ADE48541 ADE48542 ADE48545 ADE48547 ADE48553 ADE48557 ADE48559 ADW77314 ADW77316 ADW77318 ADW77320 ADW77321 ADW77322 ADW77323 ADW77324 ADW77325 ADW77326 ADW77327 AGG40970 BAB63311 BAC54946 BAE78630 BAF31281 CAA77951 CAA77952 CAA79974 CAA79975 CAI17407 CAI17408 CAI18331 CAI18485 CAI18486 CAI18708 CAI18709 CAQ07092 CAQ07093 CAQ09226 CAQ09227 CAQ10780 CAQ10781 CAQ76268 CAQ76269 CAQ76270 CAQ76271 CAQ76272 CAQ76273 CAQ76274 CAQ76275 CAQ76277 CAQ76278 CAQ76279 CAQ76280 CAQ76281 CAQ76282 CAQ76283 CAQ76285 EAX03367 EAX03368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||