Homo sapiens Protein: RPA4 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-79088.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPA4 | ||||||||||||||||||
Protein Name | replication protein A4, 30kDa | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000362131 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-79086 (RPA4) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | As part of the alternative replication protein A complex, aRPA, binds single-stranded DNA and probably plays a role in DNA repair. Compared to the RPA2-containing, canonical RPA complex, may not support chromosomal DNA replication and cell cycle progression through S-phase. The aRPA may not promote efficient priming by DNA polymerase alpha but could support DNA polymerase delta synthesis in the presence of PCNA and replication factor C (RFC), the dual incision/excision reaction of nucleotide excision repair and RAD51-dependent strand exchange. {ECO:0000269PubMed:19116208, ECO:0000269PubMed:19942684, ECO:0000269PubMed:19996105, ECO:0000269PubMed:20545304}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:19942684}. Note=Localizes to DNA repair foci after DNA damage. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Preferentially expressed in placental and colon mucosa. Widely expressed at intermediate or lower levels. {ECO:0000269PubMed:19996105}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004365
OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type IPR012340 Nucleic acid-binding, OB-fold IPR014646 Replication factor A protein 2 IPR014892 Replication protein A, C-terminal |
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PFAM |
PF01336
PF08784 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF036949
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SMART | |||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q13156 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 29935 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.659349 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_037479 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:30305 | ||||||||||||||||||
OMIM | 300767 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35345 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06591 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AF494047 BC069791 BC069808 BC069824 BC104013 BC104014 U24186 Z86061 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAB08488 AAH69791 AAH69808 AAH69824 AAI04014 AAI04015 AAM09569 CAI42256 | ||||||||||||||||||