Homo sapiens Protein: LSM2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-79229.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LSM2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000364813 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-79227 (LSM2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. May be involved in pre-mRNA splicing. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 67 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001163
Ribonucleoprotein LSM domain IPR006649 Ribonucleoprotein LSM domain, eukaryotic/archaea-type IPR010920 Like-Sm (LSM) domain IPR016654 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2 |
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PFAM |
PF01423
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF016394
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SMART |
SM00651
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Y333 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9Y333 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 57819 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.618091 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_067000 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:13940 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 607282 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4722 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06282 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF134726 AF136977 AF182288 AF196468 AJ245416 AL929592 BA000025 BC009192 CH471081 CR542146 CR542157 CR759787 CR759915 CR925765 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD21818 AAD56226 AAG33023 AAG49438 AAH09192 BAB63302 CAB52190 CAG46943 CAG46954 CAI18462 CAQ07255 CAQ10128 CAQ10626 EAX03525 | ||||||||||||||||||||||