Homo sapiens Protein: ARFGEF2 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-80061.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARFGEF2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | ADP-ribosylation factor guanine nucleotide-exchange factor 2 (brefeldin A-inhibited) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BIG2; dJ1164I10.1; PVNH2; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000360985 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-80059 (ARFGEF2) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Promotes guanine-nucleotide exchange on ARF1 and ARF3 and to a lower extend on ARF5 and ARF6. Promotes the activation of ARF1/ARF5/ARF6 through replacement of GDP with GTP. Involved in the regulation of Golgi vesicular transport. Required for the integrity of the endosomal compartment. Involved in trafficking from the trans-Golgi network (TGN) to endosomes and is required for membrane association of the AP-1 complex and GGA1. Seems to be involved in recycling of the transferrin receptor from recycling endosomes to the plasma membrane. Probably is involved in the exit of GABA(A) receptors from the endoplasmic reticulum. Involved in constitutive release of tumor necrosis factor receptor 1 via exosome-like vesicles; the function seems to involve PKA and specifically PRKAR2B. Proposed to act as A kinase-anchoring protein (AKAP) and may mediate crosstalk between Arf and PKA pathways. {ECO:0000269PubMed:12051703, ECO:0000269PubMed:12571360, ECO:0000269PubMed:15385626, ECO:0000269PubMed:16477018, ECO:0000269PubMed:17276987, ECO:0000269PubMed:18625701, ECO:0000269PubMed:20360857}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Membrane. Golgi apparatus. Cytoplasm, perinuclear region. Golgi apparatus, trans-Golgi network {ECO:0000250}. Endosome {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome. Cell projection, dendrite {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle {ECO:0000250}. Cell junction, synapse {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Note=Translocates from cytoplasm to membranes upon cAMP treatment. Localized in recycling endosomes. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Periventricular nodular heterotopia 2 (PVNH2) [MIM:608097]: A developmental disorder characterized by the presence of periventricular nodules of cerebral gray matter, resulting from a failure of neurons to migrate normally from the lateral ventricular proliferative zone, where they are formed, to the cerebral cortex. PVNH2 is an autosomal recessive form characterized by microcephaly (small brain), severe developmental delay and recurrent infections. No anomalies extrinsic to the central nervous system, such as dysmorphic features or grossly abnormal endocrine or other conditions, are associated with PVNH2. {ECO:0000269PubMed:14647276}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in placenta, lung, heart, brain, kidney and pancreas. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 29 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000904
Sec7 domain IPR015403 Domain of unknown function DUF1981, Sec7 associated IPR016024 Armadillo-type fold |
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PFAM |
PF01369
PF09324 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00222
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Y6D5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9Y6D5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q59FR3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10564 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.707198 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006411 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15853 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605371 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13411 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09250 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209397 AF084521 AL049537 AL121903 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD38428 BAD92634 CAI19320 CAI19614 | ||||||||||||||||||||||||||||||