Homo sapiens Protein: SP100 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-82953.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SP100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | SP100 nuclear antigen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | lysp100b; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000264052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-82951 (SP100) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Together with PML, this tumor suppressor is a major constituent of the PML bodies, a subnuclear organelle involved in a large number of physiological processes including cell growth, differentiation and apoptosis. Functions as a transcriptional coactivator of ETS1 and ETS2 according to PubMed:11909962. Under certain conditions, it may also act as a corepressor of ETS1 preventing its binding to DNA according to PubMed:15247905. Through the regulation of ETS1 it may play a role in angiogenesis, controlling endothelial cell motility and invasion. Through interaction with the MRN complex it may be involved in the regulation of telomeres lengthening. May also regulate TP53- mediated transcription and through CASP8AP2, regulate FAS-mediated apoptosis. Also plays a role in infection by viruses, including human cytomegalovirus and Epstein-Barr virus, through mechanisms that may involve chromatin and/or transcriptional regulation. {ECO:0000269PubMed:11909962, ECO:0000269PubMed:14647468, ECO:0000269PubMed:15247905, ECO:0000269PubMed:15592518, ECO:0000269PubMed:15767676, ECO:0000269PubMed:16177824, ECO:0000269PubMed:17245429, ECO:0000269PubMed:21118961, ECO:0000269PubMed:21274506, ECO:0000269PubMed:21880768}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus, PML body. Cytoplasm. Note=Differences in the subnuclear localization of the different isoforms seem to exist and may also be cell cycle- and interferon- dependent. Accumulates in the cytoplasm upon FAS activation.Isoform Sp100-C: Nucleus {ECO:0000269PubMed:11313457}. Note=Forms a reticulate or track- like nuclear pattern with denser concentrations at the nuclear lamina and surrounding the nucleoli, a pattern reminiscent of heterochromatin-rich regions according to PubMed:11313457. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. Sp100-B is expressed only in spleen, tonsil, thymus, mature B-cell line and some T-cell line, but not in brain, liver, muscle or non-lymphoid cell lines. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 56 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000770
SAND domain IPR004865 Sp100 IPR009071 High mobility group box domain IPR010919 SAND domain-like |
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PFAM |
PF01342
PF03172 PF00505 PF09011 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00258
SM00398 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P23497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P23497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q53TD0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.603387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11206 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 604585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC009949 AC010149 AF056322 AF076675 AF255565 AF378670 AK293373 BC011562 L79986 L79987 L79988 M60618 U36501 X95472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35537 AAC39790 AAC50743 AAF39781 AAH11562 AAK51202 AAK57703 AAL77438 AAL77439 AAL77441 AAX88870 AAY14879 BAG56886 CAA64744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||