Homo sapiens Protein: NGEF | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-83401.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NGEF | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | neuronal guanine nucleotide exchange factor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ARHGEF27; EPHEXIN; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000264051 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-83399 (NGEF) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Acts as a guanine nucleotide exchange factor (GEF) which differentially activates the GTPases RHOA, RAC1 and CDC42. Plays a role in axon guidance regulating ephrin-induced growth cone collapse and dendritic spine morphogenesis. Upon activation by ephrin through EPHA4, the GEF activity switches toward RHOA resulting in its activation. Activated RHOA promotes cone retraction at the expense of RAC1- and CDC42-stimulated growth cone extension (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Membrane {ECO:0000250}. Cell projection, growth cone {ECO:0000250}. Note=Associated with membranes. Localizes to axonal growth cones (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in brain specifically in caudate nucleus and to a lower extent in amygdala and hippocampus. Also detected in lung. {ECO:0000269PubMed:10777665}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 19 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000219
Dbl homology (DH) domain IPR001452 SH3 domain IPR001849 Pleckstrin homology domain IPR011511 Variant SH3 domain |
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PFAM |
PF00621
PF00018 PF14604 PF00169 PF07653 |
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PRINTS |
PR00452
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00325
SM00326 SM00233 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8N5V2 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8N5V2 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JTV7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 25791 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.97316 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_062824 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7807 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605991 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2500 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10442 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC016692 AC106876 AJ238899 AK293203 AK297390 BC031573 BC073962 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH31573 AAH73962 AAX93288 AAY24359 BAG56743 BAG59830 CAC00686 | ||||||||||||||||||||||