Homo sapiens Protein: PDCD1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-85348.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDCD1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | programmed cell death 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD279; hPD-1; hPD-l; hSLE1; PD-1; PD1; SLEB2; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000335062 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-85346 (PDCD1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Inhibitory cell surface receptor involved in the regulation of T-cell function during immunity and tolerance. Upon ligand binding, inhibits T-cell effector functions in an antigen- specific manner. Possible cell death inducer, in association with other factors. {ECO:0000269PubMed:21276005}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane; Single-pass type I membrane protein. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Systemic lupus erythematosus 2 (SLEB2) [MIM:605218]: A chronic, relapsing, inflammatory, and often febrile multisystemic disorder of connective tissue, characterized principally by involvement of the skin, joints, kidneys and serosal membranes. It is of unknown etiology, but is thought to represent a failure of the regulatory mechanisms of the autoimmune system. The disease is marked by a wide range of system dysfunctions, an elevated erythrocyte sedimentation rate, and the formation of LE cells in the blood or bone marrow. {ECO:0000269PubMed:12402038}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003596
Immunoglobulin V-set, subgroup IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013106 Immunoglobulin V-set domain |
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PFAM |
PF07686
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00406
SM00409 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q15116 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q15116 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E7ER21 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5133 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.158297 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005009 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8760 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 600244 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33428 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02590 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC131097 AF363458 AK313848 AY238517 BC074740 CH471063 EF064716 L27440 U64863 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC41700 AAC51773 AAH74740 AAN64003 AAO63583 ABK41899 BAG36577 EAW71298 | ||||||||||||||||||||||