Homo sapiens Protein: COL20A1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-85969.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | COL20A1 | ||||||||||||||||||
Protein Name | collagen, type XX, alpha 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000351767 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-85965 (COL20A1) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Probable collagen protein. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | High expression in heart, lung, liver, skeletal muscle, kidney, pancreas, spleen, testis, ovary, subthalamic nucleus and fetal liver. Weak expression in other tissues tested. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001791
Laminin G domain IPR002035 von Willebrand factor, type A IPR003961 Fibronectin, type III IPR008160 Collagen triple helix repeat IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily |
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PFAM |
PF00054
PF02210 PF00092 PF00041 PF01108 PF01391 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00210
SM00282 SM00327 SM00060 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9P218 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9P218 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 57642 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.271285 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_065933 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14670 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS46628 | ||||||||||||||||||
HPRD | 17215 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB040943 AI272270 AL121827 BC013658 BC019637 BC043183 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH13658 AAH19637 AAH43183 BAA96034 | ||||||||||||||||||