Homo sapiens Protein: NHP2L1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-9370.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | NHP2L1 | ||||||||||||||||||
Protein Name | NHP2 non-histone chromosome protein 2-like 1 (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | 15.5K; FA-1; FA1; NHPX; OTK27; SNRNP15-5; SNU13; SPAG12; SSFA1; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000347401 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-9368 (NHP2L1) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Binds to the 5'-stem-loop of U4 snRNA and may play a role in the late stage of spliceosome assembly. The protein undergoes a conformational change upon RNA-binding. {ECO:0000269PubMed:10545122, ECO:0000269PubMed:17412961}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000269PubMed:10593953, ECO:0000269PubMed:12429849, ECO:0000269Ref.7}. Note=Concentrated in the dense fibrillar component of the nucleolus. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 121 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000948
Ribosomal protein L7Ae, prokaryotes IPR002415 H/ACA ribonucleoprotein complex, subunit Nhp2, eukaryote IPR004038 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 IPR013241 RNase P, subunit Pop3 IPR018492 Ribosomal protein L7Ae/L8/Nhp2 family IPR029064 50S ribosomal protein L30e-like |
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PFAM |
PF01248
PF08228 |
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PRINTS |
PR00884
PR00883 PR00881 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | P55769 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P55769 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6FHM6 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4809 | ||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001003796 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7819 | ||||||||||||||||||
OMIM | 601304 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33653 | ||||||||||||||||||
HPRD | 03197 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AF091076 AF155235 AK311800 BC005358 BC019282 BC095439 CH471095 CR456531 CR541725 D50420 Z83840 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAC72945 AAF06959 AAH05358 AAH19282 AAH95439 BAA23363 BAG34743 CAB46207 CAG30417 CAG46526 EAW60450 EAW60451 EAW60453 | ||||||||||||||||||