Homo sapiens Protein: PRDM1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-94829.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRDM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | PR domain containing 1, with ZNF domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BLIMP1; PRDI-BF1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000358092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-94825 (PRDM1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcriptional repressor that binds specifically to the PRDI element in the promoter of the beta-interferon gene. Drives the maturation of B-lymphocytes into Ig secreting cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:21421998}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 58 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001214
SET domain IPR007087 Zinc finger, C2H2 IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR016608 PR-domain zinc finger protein PRDM1 |
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PFAM |
PF00856
PF00096 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF013212
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SMART |
SM00317
SM00355 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O75626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O75626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5T4E8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.436023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF084199 AL022067 AL358952 AY198414 AY198415 BC103832 BC103833 BC103834 CH471051 EF064715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC33300 AAI03833 AAI03834 AAI03835 AAO45623 AAO45624 ABK41898 CAI42295 CAQ52574 CAQ52608 EAW48419 EAW48420 EAW48421 EAW48422 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||