Homo sapiens Protein: PRDM1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-94833.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRDM1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PR domain containing 1, with ZNF domain | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BLIMP1; PRDI-BF1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000358085 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-94825 (PRDM1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Transcriptional repressor that binds specifically to the PRDI element in the promoter of the beta-interferon gene. Drives the maturation of B-lymphocytes into Ig secreting cells. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:21421998}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 58 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001214
SET domain IPR007087 Zinc finger, C2H2 IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR016608 PR-domain zinc finger protein PRDM1 |
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PFAM |
PF00856
PF00096 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF013212
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SMART |
SM00317
SM00355 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O75626 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O75626 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B4DW27 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 639 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.436023 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_878911 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9346 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603423 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34505 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04572 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF084199 AK301341 AL022067 AL358952 AY198414 AY198415 BC103832 BC103833 BC103834 CH471051 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC33300 AAI03833 AAI03834 AAI03835 AAO45623 AAO45624 BAG62889 CAI42295 CAQ52574 CAQ52608 EAW48419 EAW48421 EAW48422 | ||||||||||||||||||||||