Homo sapiens Protein: RBBP4 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-95784.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBBP4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | retinoblastoma binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | lin-53; NURF55; RBAP48; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000362584 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-95780 (RBBP4) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Core histone-binding subunit that may target chromatin assembly factors, chromatin remodeling factors and histone deacetylases to their histone substrates in a manner that is regulated by nucleosomal DNA. Component of several complexes which regulate chromatin metabolism. These include the chromatin assembly factor 1 (CAF-1) complex, which is required for chromatin assembly following DNA replication and DNA repair; the core histone deacetylase (HDAC) complex, which promotes histone deacetylation and consequent transcriptional repression; the nucleosome remodeling and histone deacetylase complex (the NuRD complex), which promotes transcriptional repression by histone deacetylation and nucleosome remodeling; the PRC2/EED-EZH2 complex, which promotes repression of homeotic genes during development; and the NURF (nucleosome remodeling factor) complex. {ECO:0000269PubMed:10866654}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 216 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001680
WD40 repeat IPR017986 WD40-repeat-containing domain IPR020472 G-protein beta WD-40 repeat IPR022052 Histone-binding protein RBBP4, N-terminal |
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PFAM |
PF00400
PF12265 |
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PRINTS |
PR00320
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q09028 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q09028 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PND5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5928 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.16003 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9887 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602923 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04232 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC114489 AK222779 AK299251 AK312571 BC003092 BC015123 BC053904 BC075836 BT007309 CH471059 X71810 X74262 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH03092 AAH15123 AAH53904 AAH75836 AAP35973 BAD96499 BAG35466 BAG61282 CAA50685 CAA52321 EAX07513 EAX07514 | ||||||||||||||||||||||||||||||