Homo sapiens Protein: SF3A3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-96554.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF3A3 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | splicing factor 3a, subunit 3, 60kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | PRP9; PRPF9; SAP61; SF3a60; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000362110 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-96552 (SF3A3) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Subunit of the splicing factor SF3A required for 'A' complex assembly formed by the stable binding of U2 snRNP to the branchpoint sequence (BPS) in pre-mRNA. Sequence independent binding of SF3A/SF3B complex upstream of the branch site is essential, it may anchor U2 snRNP to the pre-mRNA. May also be involved in the assembly of the 'E' complex. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 80 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000690
Zinc finger, C2H2-type matrin IPR021966 Splicing factor SF3a60 binding domain IPR024598 Domain of unknown function DUF3449 |
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PFAM |
PF12108
PF11931 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q12874 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q12874 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10946 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.77897 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006793 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10767 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605596 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS428 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10411 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL603790 BC002395 BC011523 CH471059 U08815 X81789 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA19625 AAH02395 AAH11523 CAA57388 CAH69930 EAX07304 EAX07305 | ||||||||||||||||||||||