Homo sapiens Protein: PABPC4 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-96715.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PABPC4 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | poly(A) binding protein, cytoplasmic 4 (inducible form) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | APP-1; APP1; iPABP; PABP4; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000361949 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-96711 (PABPC4) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Binds the poly(A) tail of mRNA. May be involved in cytoplasmic regulatory processes of mRNA metabolism. Can probably bind to cytoplasmic RNA sequences other than poly(A) in vivo (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:17289661}. Note=Localized in cytoplasmic mRNP granules containing untranslated mRNAs. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed at low levels in resting normal T cells; following T-cell activation, however, mRNA levels are rapidly up-regulated. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 73 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR002004 Polyadenylate-binding protein/Hyperplastic disc protein IPR003954 RNA recognition motif domain, eukaryote IPR006515 Polyadenylate binding protein, human types 1, 2, 3, 4 |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00076
PF00658 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00517 SM00361 |
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13310 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q13310 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1ANR1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8761 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.655282 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001129125 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8557 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603407 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44115 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04557 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL365277 AL845289 BC065540 BC094755 CH471059 U33818 U75686 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB97309 AAC50350 AAH65540 AAH94755 CAI12298 CAI12300 CAI16412 CAI16414 EAX07263 EAX07264 | ||||||||||||||||||||||