Homo sapiens Protein: SCAF8 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-98241.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SCAF8 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | SR-related CTD-associated factor 8 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RBM16; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000356146 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-246149 (SCAF8) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May play a role in mRNA processing. {ECO:0000269PubMed:11101529}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus matrix. Note=Detected in granular nuclear foci which correspond to sites of active transcription. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 27 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR006569 CID domain IPR006903 RNA polymerase II-binding domain IPR008942 ENTH/VHS |
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PFAM |
PF00076
PF04818 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00582 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UPN6 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UPN6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9H8B2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22828 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.603396 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_055707 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20959 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5247 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11487 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB029039 AK023859 AL121952 AL136976 AL591499 AL833928 BC070071 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH70071 BAA83068 BAB14705 CAD38784 CAH70694 CAI21474 CAI21482 | ||||||||||||||||||||||