Homo sapiens Gene: S100A9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-102644.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | S100A9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | S100 calcium binding protein A9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 60B8AG; CAGB; CFAG; CGLB; L1AG; LIAG; MAC387; MIF; MRP14; NIF; P14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
S100 calcium binding protein A9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
S100A9 is an intracellular calcium-binding protein that promotes neutrophil/monocyte recruitment at inflamed tissues by enhancing attachment to endothelial cells.
S100A9 is a myeloid-related protein that rapidly modulates macrophage nitric oxide production during innate immune response.
S100A9 (calgranulin B) and S100A8 (calgranulin A) form an antimicrobial heterodimeric complex known as calprotectin. Bacterial flagellin induces the upregulation of S100A9/S100A8 heterodimer via a TLR5-dependent mechanism in epidermal keratinocytes.
S100A9 forms a complex with S100A8 and the complex is the site of interplay between extracellular Ca(2+) entry and intra-phagosomal reactive oxygen species production. S100A8 :: S100A9 acts as Ca(2+) sensor in phagosomal ROS production.
S100A9-deficient murine neutrophils exhibited a reduce secretion of cytokines in response to TLR4 stimulation. In contrast, S100A9-deficient dendritic cells showed an exacerbated release of cytokines after TLR stimulation. S100A9 has no effect on the inflammatory status of macrophages. (Demonstrated in murine model)
S100A9 is strongly upregulated in neutrophils upon bacterial infection, and sequesters zinc as a mechanism of nutritional immunity. Salmonella typhimurium overcomes this defence mechanism by expressing a high affinity zinc transporter. (Demonstrated in mice)
S100A9 forms a heterodimer with S100A8 and is a key player in protective innate immunity during Klebsiella pneumonia infection.
S100A8::S100A9 heterodimer sequesters Mn(2+) and Zn(2+) to starve bacteria of these essential nutrients.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] S100a9 forms a complex with S100a8 and the complex is the site of interplay between extracellular Ca(2+) entry and intra-phagosomal reactive oxygen species production. S100a8 :: S100a9 acts as Ca(2+) sensor in phagosomal ROS production.
[Mus musculus] S100a9-deficient murine neutrophils exhibited a reduce secretion of cytokines in response to Tlr4 stimulation. In contrast, S100a9-deficient dendritic cells showed an exacerbated release of cytokines after TLR stimulation. S100a9 has no effect on the inflammatory status of macrophages.
[Mus musculus] S100a9 is strongly upregulated in neutrophils upon bacterial infection, and sequesters zinc as a mechanism of nutritional immunity. Salmonella typhimurium overcomes this defence mechanism by expressing a high affinity zinc transporter.
[Mus musculus] S100A9 forms a heterodimer with S100A8 and is a key player in protective innate immunity during Klebsiella pneumonia infection.
[Mus musculus] S100a8/S100a9 are proinflammatory proteins that activate natural killer cells via Ager signalling.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the S100 family of proteins containing 2 EF-hand calcium-binding motifs. S100 proteins are localized in the cytoplasm and/or nucleus of a wide range of cells, and involved in the regulation of a number of cellular processes such as cell cycle progression and differentiation. S100 genes include at least 13 members which are located as a cluster on chromosome 1q21. This protein may function in the inhibition of casein kinase and altered expression of this protein is associated with the disease cystic fibrosis. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:153357854-153361027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 97 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Endogenous TLR signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||