Version 5.4
| Homo sapiens Gene: SMG5 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-103447.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SMG5 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | EST1B; LPTS-RP1; LPTSRP1; SMG-5 | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000198952 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans)
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
SMG5 is involved in nonsense-mediated mRNA decay (Ohnishi et al., 2003 [PubMed 14636577]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 1:156249224-156282825 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | q22 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Gene Expression pathway
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| KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
Regulation of Telomerase
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| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9UPR3 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 23381 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.516837 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_015327 XM_006711248 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:24644 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 610962 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS1137 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB029012 AB085691 AL135927 AL137738 AL589685 AY168922 AY336728 BC007453 BC038296 CH471121 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH07453 AAH38296 AAO17582 AAQ84301 BAA83041 BAC53623 CAH56374 CAI14160 CAI15525 EAW52973 EAW52974 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 23381 | ||||||||||||||||||