Mus musculus Gene: Mmp1a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-132664.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Mmp1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | matrix metallopeptidase 1a (interstitial collagenase) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Mcol-A; Mcola | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000043089 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
matrix metallopeptidase 1a (interstitial collagenase)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000196611:
Proteins of the matrix metalloproteinase (MMP) family are involved in the breakdown of extracellular matrix in normal physiological processes, such as embryonic development, reproduction, and tissue remodeling, as well as in disease processes, such as arthritis and metastasis. Most MMP's are secreted as inactive proproteins which are activated when cleaved by extracellular proteinases. This gene encodes a secreted enzyme which breaks down the interstitial collagens, types I, II, and III. The gene is part of a cluster of MMP genes which localize to chromosome 11q22.3. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Mar 2009] Proteins of the matrix metalloproteinase (MMP) family are involved in the breakdown of extracellular matrix in normal physiological processes, such as embryonic development, reproduction, and tissue remodeling, as well as in disease processes, such as arthritis and metastasis. Most MMP\'s are secreted as inactive proproteins which are activated when cleaved by extracellular proteinases. This gene encodes a secreted enzyme which breaks down the interstitial collagens, types I, II, and III. The gene is part of a cluster of MMP genes which localize to chromosome 11q22.3. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Mar 2009] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:7464141-7476869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Hemostasis pathway
Activation of Matrix Metalloproteinases pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Extracellular matrix organization pathway
Metabolism of proteins pathway
Regulation of Insulin-like Growth Factor (IGF) transport and uptake by Insulin-like Growth Factor Binding Proteins (IGFBPs) pathway
Basigin interactions pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
Collagen degradation pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Bladder cancer pathway
PPAR signaling pathway pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Basigin interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Regulation of Insulin-like Growth Factor (IGF) transport and uptake by Insulin-like Growth Factor Binding Proteins (IGFBPs) pathway
Activation of Matrix Metalloproteinases pathway
Collagen degradation pathway
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
Metabolism of proteins pathway
Hemostasis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Bladder cancer pathway
PPAR signaling pathway pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated transcriptional targets of AP1 family members Fra1 and Fra2
AP-1 transcription factor network
Glucocorticoid receptor regulatory network
Endothelins
Syndecan-1-mediated signaling events
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9EPL5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9QPT8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 83995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.156952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_032006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1933846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Mmp1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC115689 AJ278462 AK049552 AY211543 BC117756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI17757 AAO37582 BAC33807 CAC18880 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 83995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||