Mus musculus Protein: Mmp1a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-132666.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Mmp1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | matrix metallopeptidase 1a (interstitial collagenase) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Mcol-A; Mcola; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000034492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-132664 (Mmp1a) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Cleaves collagens of types I, II, and III at one site in the helical domain. Also cleaves collagens of types VII and X (By similarity). Able to degrade synthetic peptides and type I and II fibrillar collagen. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1933846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000585
Hemopexin-like domain IPR001818 Peptidase M10, metallopeptidase IPR002477 Peptidoglycan binding-like IPR006026 Peptidase, metallopeptidase IPR016293 Peptidase M10A, stromelysin-type IPR018487 Hemopexin-like repeats IPR021190 Peptidase M10A |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00413
PF01471 PF00045 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00138
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF001191
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00235
SM00120 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9EPL5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9QPT8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 83995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.156952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_114395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Mmp1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC115689 AJ278462 AK049552 AY211543 BC117756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI17757 AAO37582 BAC33807 CAC18880 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||