Mus musculus Gene: Scarf2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-140230.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Scarf2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | scavenger receptor class F, member 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000012017 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
scavenger receptor class F, member 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000244486:
The protein encoded by this gene is similar to SCARF1/SREC-I, a scavenger receptor protein that mediates the binding and degradation of acetylated low density lipoprotein (Ac-LDL). This protein has only little activity of internalizing modified low density lipoproteins (LDL), but it can interact with SCARF1 through its extracellular domain. The association of this protein with SCARF1 is suppressed by the presence of scavenger ligands. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:17797282-17808287 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P59222 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q58A84 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 224024 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_153790 XM_006522042 XM_006536804 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28010 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1858430 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Scarf2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB024432 AF522197 BC139758 CH466521 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI39759 AAN45862 BAD93344 EDK97482 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 224024 | ||||||||||||||||||||||