Mus musculus Gene: Pbrm1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-144501.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pbrm1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | polybromo 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610016F04Rik; AI507524; BAF180; Pb1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000042323 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
polybromo 1
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000163939:
This locus encodes a subunit of ATP-dependent chromatin-remodeling complexes. The encoded protein has been identified as in integral component of complexes necessary for ligand-dependent transcriptional activation by nuclear hormone receptors. Mutations at this locus have been associated with primary clear cell renal cell carcinoma. [provided by RefSeq, Feb 2012] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:31019138-31121592 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 34 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z1M8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 66923 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.27913 Mm.413281 Mm.442229 Mm.444818 Mm.445686 Mm.473317 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081251 XM_006519402 XM_006519403 XM_006519404 XM_006519405 XM_006519406 XM_006519407 XM_006519408 XM_006519409 XM_006519410 XM_006519411 XM_006519412 XM_006519413 XM_006519414 XM_006519416 XM_006519418 XM_006519421 XM_006519423 XM_006519425 XM_006519426 XM_006519427 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36851 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1923998 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pbrm1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC154446 AC154727 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 66923 | ||||||||||||||||||||||